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新研究通过单细胞+AI发现最佳抗癌T细胞,助力CAR-T疗法
2024/05/29

近日,美国休斯顿大学的研究人员在Nature子刊Nature Cancer上发表了题为Identification of a clinically efficacious CAR T cell subset in diffuse large B cell lymphoma by dynamic multidimensional single-cell profiling ”的研究论文。该研究发现了一种被称为CD8-fit T细胞的最佳抗癌T细胞亚群,其具有高迁移率和连续杀伤能力,有望用于增强CAR-T细胞疗法的抗癌效果。

在这项研究中,研究团队使用专利技术TIMING(纳米孔网格中的延时显微成像),该技术将视觉人工智能(visual AI)应用于评估细胞行为、运动和杀伤能力 。

研究团队使用TIMING技术跟踪了用于治疗大B细胞淋巴瘤的CAR-T细胞的数千个细胞中单个T细胞与肿瘤细胞之间的相互作用,并将这些结果与单细胞RNA测序数据相结合。从中发现了一种名为CD8-fit T细胞的T细胞亚群具有高迁移能力和连续杀伤能力,且拥有平衡的线粒体和溶酶体体积。这些特殊的T细胞仅在对CAR-T细胞疗法有临床反应的患者中发现。


该团队还发现,cd8贴合标签存在于预先制备的T细胞中,并在输入后的患者中长期持续存在,最重要的是,cd8贴合标签与长期阳性临床应答相关。根据研究人员的说法,这些T细胞很可能在其他肿瘤中产生临床益处。

研究团队进一步利用独立的数据集,验证了这些CD8-fit T细胞:

1)在制造CAR-T细胞前就存在,与使用axicabtagene ciloleucel疗法(吉利德/Kite开发的CD19-CAR-T细胞疗法)治疗的患者的临床反应相关;

2)在接受CAR-T细胞治疗后,在患者体内长期存在;

3)是能够在实体瘤内进行扩增的肿瘤迁移性杀伤细胞。

这些研究结果表明,结合单细胞功能评估的多模态整合对于发现和应用CD8-fit T细胞作为细胞疗法中具有最佳适应性的T细胞亚群具有重要意义。

 

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